伊甸基金會長期關懷弱勢社區，除了緊急召募志工及物資進入救援外，已經針對重災區的高雄縣旗山鎮地區、屏東東港鎮先行進行家庭訪視、物資運送、家園重建的工作。
莫拉克颱風強風豪雨襲捲全台，尤其中南部地區帶來驚人的雨量，多處弱勢偏遠地區居民被迫遷移，甚至對外交通受阻，急待救援。
伊甸基金會已掌握雲林、嘉義、南投、花蓮、台東及高雄、屏東等弱勢社區的現況與需求，但因高雄縣旗山地區對外交通失聯，伊甸工作人員及志工除了全都加入高雄縣救災隊的救援工作，也將在道路搶通的第一時間立即協助家園重建的工作。
對水災後的災民來說，面對災後破毀的家園、家人的三餐溫飽、孩子的開學費用，更令人感到痛心的是無依無助的孩子，或是留在故鄉守護家園的年邁的祖父母，重建的工作對他們來說是難上加難，為此，伊甸邀請民眾投入志工行列，加入「守護家園重建服務隊」，並捐款支持，協助弱勢社區家園重建。
(一) 應變階段
1.協助發展遲緩兒童、清寒家庭孩童、清身心障礙者、獨居老人等受災家庭物資運送及家園清潔重建工作。
2.急難救助金發放。
3.民生及衛生用品募集、補助與發放。
‧清潔打掃用品，如：掃把、拖把、抹布、棉布手套、清潔劑、乾洗手劑等
‧半耐久性食材，如：水、白米、乾麵條、罐頭/瓶裝/袋裝食品等
‧簡易衛生用品，如：消毒雙氧水、碘酒、OK蹦、萬用繃帶、衛生棉等
4.動員全國民眾，成立「守護家園重建服務隊」。
(二) 復原階段
‧兒童就學：針對受災戶孩童有關就學經費、就讀、交通協助，以及開學後進行課後輔導。
‧生活照顧：生活自理功能不足的發展遲緩兒童、身心障礙者、獨居老人等，協助送餐、清潔、家事服務、陪同就醫等照顧服務。
‧協助受災戶職業重建。
